以下是可以被發送到FTP服務器的FTP命令列表，包含由IETF在RFC 959中標準化的所有命令。需要注意的是，大多數命令行FTP客戶端都給用戶提供了額外的命令集。例如，GET是一個常見的用來下載文件的用戶命令，用來替代原始的RETR命令。
| 命令 | RFC | 描述 |
|---|---|---|
| ABOR | (ABORT)此命令使服務器終止前一個FTP服務命令以及任何相關數據傳輸。 | |
| ACCT | (ACCOUNT)此命令的參數部分使用一個Telnet字符串來指明用戶的賬戶。 | |
| ADAT | RFC 2228 | (AUTHENTICATION/SECURITY DATA)認證/安全數據 |
| ALLO | 為接收一個文件分配足夠的磁盤空間 | |
| APPE | 增加 | |
| AUTH | RFC 2228 | 認證/安全機制 |
| CCC | RFC 2228 | 清除命令通道 |
| CDUP | 改變到父目錄 | |
| CONF | RFC 2228 | 機密性保護命令 |
| CWD | 改變工作目錄 | |
| DELE | 刪除文件 | |
| ENC | RFC 2228 | 隱私保護通道 |
| EPRT | RFC 2428 | 為服務器指定要連接的擴展地址和端口 |
| EPSV | RFC 2428 | 進入擴展被動模式 |
| FEAT | RFC 2389 | 獲得服務器支持的特性列表 |
| HELP | 如果指定了命令，返回命令使用文檔；否則返回一個通用幫助文檔 | |
| LANG | RFC 2640 | 語言協商 |
| LIST | 如果指定了文件或目錄，返回其信息；否則返回當前工作目錄的信息 | |
| LPRT | RFC 1639 | 為服務器指定要連接的長地址和端口 |
| LPSV | RFC 1639 | 進入長被動模式 |
| MDTM | RFC 3659 | 返回指定文件的最后修改時間 |
| MIC | RFC 2228 | 完整性保護命令 |
| MKD | 創建目錄 | |
| MLSD | RFC 3659 | 如果目錄被命名，列出目錄的內容 |
| MLST | RFC 3659 | 提供命令行指定的對象的數據 |
| MODE | 設定傳輸模式（流、塊或壓縮） | |
| NLST | 返回指定目錄的文件名列表 | |
| NOOP | 無操作（啞包；通常用來保活） | |
| OPTS | RFC 2389 | 為特性選擇選項 |
| PASS | 認證密碼 | |
| PASV | 進入被動模式 | |
| PBSZ | RFC 2228 | 保護緩沖大小 |
| PORT | 指定服務器要連接的地址和端口 | |
| PROT | RFC 2228 | 數據通道保護級別 |
| PWD | 打印工作目錄，返回主機的當前目錄 | |
| QUIT | 斷開連接 | |
| REIN | 重新初始化連接 | |
| REST | 從指定點重新開始傳輸 | |
| RETR | 傳輸文件副本 | |
| RMD | 刪除目錄 | |
| RNFR | 從…重命名 | |
| RNTO | 重命名到… | |
| SITE | 發送站點特殊命令到遠端服務器 | |
| SIZE | RFC 3659 | 返回文件大小 |
| SMNT | 掛載文件結構 | |
| STAT | 返回當前狀態 | |
| STOR | 接收數據并且在服務器站點保存為文件 | |
| STOU | 唯一地保存文件 | |
| STRU | 設定文件傳輸結構 | |
| SYST | 返回系統類型 | |
| TYPE | 設定傳輸模式（ASCII/二進制). | |
| USER | 認證用戶名 | |
| XCUP | &1000775 RFC 775 | 改變之當前工作目錄的父目錄 |
| XMKD | &1000775 RFC 775 | 創建目錄 |
| XPWD | &1000775 RFC 775 | 打印當前工作目錄 |
| XRCP | &1000743 RFC 743 | |
| XRMD | &1000775 RFC 775 | 刪除目錄 |
| XRSQ | &1000743 RFC 743 | |
| Xsem | &1000737 RFC 737 | 發送，否則郵件 |
| XSEN | &1000737 RFC 737 | 發送到終端 |